河套学院是经教育部批准建立的全日制普通本科院校，其前身是创建于1985年的河套大学，办学历史可追溯到1943年由傅作义将军创办的巴盟师范学校。2001年和2004年，经过两次教育资源的优化，整合了巴彦淖尔地区的七所院校。2012年经教育部批准晋升为普通本科学校，是一所以培养高素质应用型人才为主的综合性院校。

升本以来，学院根据应用型本科教育发展规律和国家提出的转型战略要求，确立了“立足西部，面向全区，培养高素质应用型人才的多科性大学”的办学定位和“以立德树人为根本，以改革创新为动力，以专业建设为龙头，以学科建设为支撑，全面推进综合改革，着力强化内涵建设，深化产教融合、校企合作，努力培养创新型、应用型人才，服务区域经济社会发展”的指导思想。按照“依靠地方，强化应用，注重服务，建设地方性、应用型、服务型高校”的发展思路，围绕提升人才培养质量这个核心，根据地区产业发展的需要及技术发展趋势，着力凝练学科方向，建设特色专业，逐步形成了多学科分层次协调发展的学科建设布局和紧密对接区域经济社会发展的应用型专业体系。

学院现在的校区占地面积692亩，校舍建筑面积24万平方米，共有各类图书(含电子读物)113.69万册，教学仪器设备总值达到7386.79万元，建成了统一的校园数字化平台，学院固定资产3.75亿元，总资产达到5.8亿元。

学院现有13个系部，附设继续教育学院、中等职业技术学校。现有28个本科专业，22个专科专业，普通本专科在校生达到 10126人;现有教职员工980人，专任教师532人，其中教授42人，副教授157人，现有博士19人，硕士269人，已建成自治区级品牌专业13个，精品课程21门，优质精品课程2门，建成自治区级教学团队9个，培养自治区级教学名师11人，教坛新秀7人。

学院2013年成为国家自然科学基金依托单位，目前各级各类科研立项293项，其中国家级、部级项目11项，自治区级项目123项，申请专利29项。教师发表学术论文1009篇，其中SCI 8篇，EI 5篇 ，ISTP 4篇，CPCI 4篇，核心期刊204篇。建成自治区重点实验室1个、自治区工程技术研究中心1个、自治区创新科技培育平台1个、自治区创新培育团队1个。学院“农学实验教学中心”和“医学实验中心”获批成为“自治区级实验教学示范中心”。

巴彦淖尔市市委、政府历来十分重视河套学院的建设和发展，多年来不断投入资金改善办学条件，提高办学质量。2013年9月28日，河套学院新校区项目在巴彦淖尔市双河区开工建设。新校区规划用地面积76.43万平方米，校区净用面积46.95万平方米，项目总投资10.2亿元，建成后能满足10000多名师生的办公、学习和生活需求，能够极大的改善学院的办学条件。